Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms