Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms