Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms