Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms