Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NRXN1Q9ULB1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NRXN1Q9ULB1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NRXN1Q9ULB1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NRXN1Q9ULB1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NRXN1Q9ULB1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms