Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRNDQ9UKY0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms