Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA4

AKAP11, A-kinase anchor protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP11Q9UKA4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AKAP11Q9UKA4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AKAP11Q9UKA4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms