Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms