Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STAG3Q9UJ98 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STAG3Q9UJ98 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STAG3Q9UJ98 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STAG3Q9UJ98 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STAG3Q9UJ98 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
STAG3Q9UJ98 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STAG3Q9UJ98 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STAG3Q9UJ98 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
STAG3Q9UJ98 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
STAG3Q9UJ98 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
STAG3Q9UJ98 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
STAG3Q9UJ98 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
STAG3Q9UJ98 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
STAG3Q9UJ98 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
STAG3Q9UJ98 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STAG3Q9UJ98 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STAG3Q9UJ98 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms