Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SFMBT1Q9UHJ3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms