Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB6

LIMA1, LIM domain and actin-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMA1Q9UHB6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LIMA1Q9UHB6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIMA1Q9UHB6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIMA1Q9UHB6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIMA1Q9UHB6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIMA1Q9UHB6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIMA1Q9UHB6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIMA1Q9UHB6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIMA1Q9UHB6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIMA1Q9UHB6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIMA1Q9UHB6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIMA1Q9UHB6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LIMA1Q9UHB6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIMA1Q9UHB6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIMA1Q9UHB6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIMA1Q9UHB6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIMA1Q9UHB6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIMA1Q9UHB6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIMA1Q9UHB6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIMA1Q9UHB6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIMA1Q9UHB6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIMA1Q9UHB6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LIMA1Q9UHB6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms