Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms