Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms