Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIP2Q9UDT6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms