Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PEF1Q9UBV8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PEF1Q9UBV8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEF1Q9UBV8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEF1Q9UBV8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEF1Q9UBV8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEF1Q9UBV8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEF1Q9UBV8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEF1Q9UBV8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEF1Q9UBV8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEF1Q9UBV8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEF1Q9UBV8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PEF1Q9UBV8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEF1Q9UBV8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEF1Q9UBV8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PEF1Q9UBV8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEF1Q9UBV8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEF1Q9UBV8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEF1Q9UBV8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEF1Q9UBV8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEF1Q9UBV8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEF1Q9UBV8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEF1Q9UBV8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PEF1Q9UBV8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms