Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms