Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAPAQ9P0L0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAPAQ9P0L0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms