Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms