Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms