Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASF1BQ9NVP2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms