Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT13Q9NUP7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRMT13Q9NUP7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRMT13Q9NUP7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRMT13Q9NUP7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT13Q9NUP7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT13Q9NUP7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT13Q9NUP7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms