Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD1Q9NUN5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD1Q9NUN5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms