Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SMC4Q9NTJ3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC4Q9NTJ3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms