Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EMILIN3Q9NT22 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms