Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms