Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms