Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms