Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDHAF3Q9NRP4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms