Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms