Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms