Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms