Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPJQ9HC77 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms