Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf49Q9H6J7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms