Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STN1Q9H668 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STN1Q9H668 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STN1Q9H668 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms