Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms