Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms