Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT23Q9C075 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT23Q9C075 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms