Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms