Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SALL3Q9BXA9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms