Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms