Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KATNB1Q9BVA0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms