Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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VAMP8Q9BV40 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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