Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TIMM29Q9BSF4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TIMM29Q9BSF4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TIMM29Q9BSF4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms