Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GINS3Q9BRX5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms