Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIKE1Q9BRV8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms