Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SDF4Q9BRK5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms