Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLF1Q9BQI6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms