Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms