Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms