Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARXQ96QS3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms